LAMMPS解析ツールの忘備録

はじめに

分子動力学計算ソフトLAMMPSの後処理解析ツールに関する忘備録です。

想定される読者

LAMMPSによる分子動力学計算後に、

• ログファイルやトラジェクトリファイルを可視化したい方
• ローカルに環境構築せず可視化したい方

解析ツール一覧

MDAnalysis

MDAnalysis · MDAnalysis

www.mdanalysis.org

LAMMPSLogPlotter

LAMMPS Log Plotter

andeplane.github.io

MDAnalysis

（準備中）

LAMMPSLogPlotter

ブラウザ上で、ログファイル（log.lammps）から物理量の時間変化等を可視化できます。

• 入力: LAMMPSのログファイル（log.lammps）
• 出力: 物理量の時間発展等の可視化グラフ

以下、使用例になります。

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1. https://andeplane.github.io/LAMMPSLogPlotter/ にアクセス
2. LAMMPSログファイル（log.lammps）のアップロード
3. 可視化したい物理用の縦軸、横軸を選択

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