LAMMPS | 物性研スパコン(ohtaka) | テスト計算 物性研スパコン システムB （ohtaka）| LAMMPSテスト計算 | ログ | 24/10/31(木)
参照先ひとこと要約物性研スパコン システムB（ohtaka）にて，LAMMPSを実行する手順をStep by Stepでトレースした．LAMMPSテスト計算（実行手順ログ）はじめに，物性研スパコン（ohtaka）にSSH接続する．（関連：過...
2024-10
LAMMPS | 物性研スパコン(ohtaka) | テスト計算 
物性研スパコン 物性研スパコン システムB （ohtaka）| 初期SSH接続設定 | ログ | 24/10/24(木)
ひとこと要約物性研スパコンシステムB（ohtaka）にSSH接続する方法として，接続元によってSSH接続ができないという問題に直面した．結論として，接続元が22番ポートを開放していない通信回線の場合，現状ままではSSH接続ができなかった．逆...
LAMMPS | 結晶成長 | On Docker 融液からの結晶成長過程再現ログ | 融液の初期構造作成まで | 結晶化再現中 | Argon | LAMMPS | 24/10/17(木)
参照先参照論文：Docker上でのLAMMPS実行環境構築（過去ログ）：アルゴン1000原子の初期座標作成（過去ログ）：3.1 シュミレーション方法のトレース | 融液の初期構造作成まで（ログ）計算条件アンサンブルNPT温度500K → 急...
VMD | 環境変数設定 | MacOS MacOS | VMD | 環境変数設定ログ | 24/10/07(月)
参照先実行環境MacBook Pro（2018）プロセッサ：2.3 GHz クアッドコアIntel Core i5グラフィックス：Intel Iris Plus Graphics 655 1536 MBメモリ：16 GB 2133 MHz ...
VMD | On Docker | MacOS VMD環境構築 | On Docker | MacOS | 24/10/3(木) | 失敗ログ
参照先過去ログDocker imageをダウンロード% pwd/Users/li/Documents/Researchdocker pull afandiadib/vmd:mesastdout:mesa: Pulling from afan...